Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD164Q04900 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD164Q04900 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD164Q04900 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD164Q04900 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD164Q04900 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD164Q04900 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CD164Q04900 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CD164Q04900 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CD164Q04900 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CD164Q04900 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CD164Q04900 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms