Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBE1Q04446 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms