Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms