Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms