Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDR2Q01850 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms