Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SATB1Q01826 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms