Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
B4GALNT1Q00973 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4GALNT1Q00973 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms