Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYBPC1Q00872 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms