Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCCQ00597 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms