Protein–RNA interactions for Protein: Q00362

CDC55, Protein phosphatase PP2A regulatory subunit B, yeastyeast

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDC55Q00362 PRP45YAL032C 1140 nt5.51□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YKL151CYKL151C 1014 nt5.51□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 ATG8YBL078C 354 nt5.51□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YOR263CYOR263C 408 nt5.51□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YPL114WYPL114W 420 nt5.51□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 ARX1YDR101C 1782 nt5.51□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 HXT5YHR096C 1779 nt5.51□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 FAT3YKL187C 2253 nt5.51□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 ESF1YDR365C 1887 nt5.51□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 PHO8YDR481C 1701 nt5.51□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 SPO23YBR250W 1572 nt5.5□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 SAC6YDR129C 1929 nt5.5□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YDR157WYDR157W 402 nt5.5□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 FAU1YER183C 636 nt5.5□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 THG1YGR024C 714 nt5.5□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 FUN19YAL034C 1242 nt5.5□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 RPS19BYNL302C 435 nt5.5□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 CWC27YPL064C 906 nt5.5□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 DCC1YCL016C 1143 nt5.5□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 TRM12YML005W 1389 nt5.5□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 ERG7YHR072W 2196 nt5.5□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 NMD3YHR170W 1557 nt5.5□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 VBA1YMR088C 1689 nt5.5□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 MKS1YNL076W 1755 nt5.5□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 RXT3YDL076C 885 nt5.49□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 IZH1YDR492W 951 nt5.49□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 TMA20YER007C-A 546 nt5.49□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 GTF1YGR102C 552 nt5.49□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YKR011CYKR011C 1062 nt5.49□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 CSR1YLR380W 1227 nt5.49□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 GIM5YML094W 492 nt5.49□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 FOL3YMR113W 1284 nt5.49□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YNL122CYNL122C 348 nt5.49□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 UBX3YDL091C 1368 nt5.49□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 UGA2YBR006W 1494 nt5.49□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 HPF1YOL155C 2904 nt5.49□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 ATG20YDL113C 1923 nt5.48□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 HCA4YJL033W 2313 nt5.48□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 MIX14YDR031W 366 nt5.48□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt5.48□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 PRO3YER023W 861 nt5.48□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 SLO1YER180C-A 258 nt5.48□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YPT35YHR105W 645 nt5.48□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YJL175WYJL175W 513 nt5.48□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt5.48□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YKL023WYKL023W 834 nt5.48□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YLR257WYLR257W 966 nt5.48□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt5.48□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 PRM6YML047C 1059 nt5.48□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 GSY2YLR258W 2118 nt5.48□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 RFA1YAR007C 1866 nt5.47□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 QDR1YIL120W 1692 nt5.47□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 PPH3YDR075W 927 nt5.47□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 TAF10YDR167W 621 nt5.47□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 MLC1YGL106W 450 nt5.47□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 RSR1YGR152C 819 nt5.47□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 MRP4YHL004W 1185 nt5.47□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt5.47□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt5.47□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YKL223WYKL223W 333 nt5.47□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YMR010WYMR010W 1218 nt5.47□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 LEM3YNL323W 1245 nt5.47□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 UTP23YOR004W 765 nt5.47□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 YOR318CYOR318C 306 nt5.47□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 MAK3YPR051W 531 nt5.47□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 NGG1YDR176W 2109 nt5.47□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 SPB4YFL002C 1821 nt5.46□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 GLO3YER122C 1482 nt5.46□□□□□ -1.53
CDC55Q00362 CDC4YFL009W 2340 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 SSZ1YHR064C 1617 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 TSC13YDL015C 933 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 GCS1YDL226C 1059 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 MAM1YER106W 909 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 LOH1YJL038C 660 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 SDH3YKL141W 597 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 YAR023CYAR023C 540 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 YMR310CYMR310C 954 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 YNL046WYNL046W 519 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 TSR4YOL022C 1227 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 TEA1YOR337W 2280 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 RAT1YOR048C 3021 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 NOC4YPR144C 1659 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 SLF1YDR515W 1344 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 FOL1YNL256W 2475 nt5.46□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 RIM101YHL027W 1878 nt5.45□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 MCM6YGL201C 3054 nt5.45□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 KRE29YER038C 1395 nt5.45□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 BRF1YGR246C 1791 nt5.45□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 MMP1YLL061W 1752 nt5.45□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 RPS11AYDR025W 471 nt5.45□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 YDR053WYDR053W 396 nt5.45□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 TIM10YHR005C-A 282 nt5.45□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 IRC9YJL142C 393 nt5.45□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 ATG27YJL178C 816 nt5.45□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 TDA5YLR426W 981 nt5.45□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 MRM1YOR201C 1239 nt5.45□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 SUL2YLR092W 2682 nt5.45□□□□□ -1.54
CDC55Q00362 AGA1YNR044W 2178 nt5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.9 ms