Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SMAD3P84022 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD3P84022 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms