Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTRA4P83105 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTRA4P83105 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms