Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM193AP78312 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM193AP78312 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM193AP78312 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM193AP78312 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM193AP78312 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM193AP78312 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM193AP78312 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms