Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBXN2AP68543 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms