Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GNB1P62873 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNB1P62873 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNB1P62873 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNB1P62873 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNB1P62873 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNB1P62873 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNB1P62873 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNB1P62873 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNB1P62873 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNB1P62873 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNB1P62873 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNB1P62873 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNB1P62873 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNB1P62873 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GNB1P62873 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GNB1P62873 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GNB1P62873 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GNB1P62873 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GNB1P62873 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GNB1P62873 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GNB1P62873 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GNB1P62873 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GNB1P62873 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GNB1P62873 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GNB1P62873 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GNB1P62873 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GNB1P62873 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GNB1P62873 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GNB1P62873 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GNB1P62873 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GNB1P62873 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GNB1P62873 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GNB1P62873 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GNB1P62873 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GNB1P62873 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GNB1P62873 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GNB1P62873 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GNB1P62873 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GNB1P62873 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GNB1P62873 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GNB1P62873 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GNB1P62873 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GNB1P62873 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GNB1P62873 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GNB1P62873 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GNB1P62873 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GNB1P62873 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB1P62873 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB1P62873 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB1P62873 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB1P62873 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB1P62873 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB1P62873 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB1P62873 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB1P62873 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB1P62873 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB1P62873 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB1P62873 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB1P62873 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB1P62873 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB1P62873 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB1P62873 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB1P62873 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB1P62873 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB1P62873 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms