Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMC6P62333 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMC6P62333 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms