Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RPS29P62273 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RPS29P62273 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RPS29P62273 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RPS29P62273 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RPS29P62273 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RPS29P62273 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RPS29P62273 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RPS29P62273 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RPS29P62273 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RPS29P62273 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RPS29P62273 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
RPS29P62273 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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