Protein–RNA interactions for Protein: P62249

RPS16, 40S ribosomal protein S16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS16P62249 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPS16P62249 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS16P62249 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS16P62249 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS16P62249 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS16P62249 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS16P62249 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS16P62249 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS16P62249 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS16P62249 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS16P62249 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS16P62249 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS16P62249 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS16P62249 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS16P62249 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS16P62249 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS16P62249 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS16P62249 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS16P62249 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS16P62249 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS16P62249 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS16P62249 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS16P62249 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS16P62249 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS16P62249 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS16P62249 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS16P62249 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS16P62249 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS16P62249 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS16P62249 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS16P62249 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS16P62249 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS16P62249 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms