Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVK11-1P61568 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms