Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP6V0D1P61421 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V0D1P61421 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms