Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms