Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms