Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIK1P57059 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIK1P57059 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIK1P57059 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIK1P57059 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIK1P57059 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIK1P57059 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIK1P57059 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIK1P57059 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIK1P57059 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIK1P57059 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIK1P57059 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIK1P57059 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIK1P57059 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIK1P57059 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIK1P57059 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIK1P57059 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIK1P57059 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIK1P57059 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIK1P57059 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIK1P57059 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIK1P57059 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIK1P57059 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIK1P57059 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIK1P57059 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIK1P57059 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIK1P57059 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIK1P57059 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIK1P57059 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIK1P57059 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SIK1P57059 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SIK1P57059 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SIK1P57059 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIK1P57059 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIK1P57059 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIK1P57059 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIK1P57059 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SIK1P57059 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SIK1P57059 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIK1P57059 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SIK1P57059 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIK1P57059 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIK1P57059 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIK1P57059 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIK1P57059 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIK1P57059 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIK1P57059 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIK1P57059 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIK1P57059 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIK1P57059 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIK1P57059 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SIK1P57059 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SIK1P57059 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SIK1P57059 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SIK1P57059 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SIK1P57059 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SIK1P57059 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SIK1P57059 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIK1P57059 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIK1P57059 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIK1P57059 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIK1P57059 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIK1P57059 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIK1P57059 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIK1P57059 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIK1P57059 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIK1P57059 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIK1P57059 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIK1P57059 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIK1P57059 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIK1P57059 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIK1P57059 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIK1P57059 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIK1P57059 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIK1P57059 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIK1P57059 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIK1P57059 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIK1P57059 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIK1P57059 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIK1P57059 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIK1P57059 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SIK1P57059 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIK1P57059 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIK1P57059 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIK1P57059 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIK1P57059 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIK1P57059 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIK1P57059 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIK1P57059 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIK1P57059 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIK1P57059 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIK1P57059 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIK1P57059 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIK1P57059 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIK1P57059 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIK1P57059 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIK1P57059 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIK1P57059 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIK1P57059 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIK1P57059 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms