Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIPPLY3P57055 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY3P57055 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms