Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AIF1P55008 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AIF1P55008 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AIF1P55008 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AIF1P55008 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AIF1P55008 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AIF1P55008 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AIF1P55008 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AIF1P55008 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AIF1P55008 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AIF1P55008 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AIF1P55008 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AIF1P55008 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AIF1P55008 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AIF1P55008 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AIF1P55008 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AIF1P55008 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AIF1P55008 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AIF1P55008 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AIF1P55008 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AIF1P55008 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AIF1P55008 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AIF1P55008 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AIF1P55008 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AIF1P55008 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AIF1P55008 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AIF1P55008 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AIF1P55008 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AIF1P55008 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AIF1P55008 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AIF1P55008 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AIF1P55008 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AIF1P55008 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AIF1P55008 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AIF1P55008 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AIF1P55008 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AIF1P55008 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AIF1P55008 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AIF1P55008 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AIF1P55008 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AIF1P55008 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AIF1P55008 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AIF1P55008 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AIF1P55008 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AIF1P55008 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AIF1P55008 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AIF1P55008 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AIF1P55008 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AIF1P55008 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AIF1P55008 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AIF1P55008 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIF1P55008 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AIF1P55008 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AIF1P55008 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AIF1P55008 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AIF1P55008 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AIF1P55008 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AIF1P55008 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AIF1P55008 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AIF1P55008 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AIF1P55008 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AIF1P55008 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AIF1P55008 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AIF1P55008 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AIF1P55008 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AIF1P55008 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AIF1P55008 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms