Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPAP53621 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPAP53621 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPAP53621 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPAP53621 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPAP53621 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPAP53621 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPAP53621 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPAP53621 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPAP53621 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPAP53621 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPAP53621 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPAP53621 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPAP53621 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPAP53621 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPAP53621 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPAP53621 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPAP53621 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPAP53621 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPAP53621 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPAP53621 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPAP53621 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPAP53621 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPAP53621 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPAP53621 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPAP53621 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPAP53621 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COPAP53621 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPAP53621 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPAP53621 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPAP53621 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPAP53621 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPAP53621 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPAP53621 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPAP53621 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPAP53621 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPAP53621 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPAP53621 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPAP53621 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPAP53621 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPAP53621 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPAP53621 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPAP53621 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPAP53621 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPAP53621 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPAP53621 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPAP53621 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPAP53621 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPAP53621 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPAP53621 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPAP53621 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPAP53621 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPAP53621 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPAP53621 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPAP53621 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPAP53621 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPAP53621 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COPAP53621 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COPAP53621 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COPAP53621 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPAP53621 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPAP53621 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPAP53621 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPAP53621 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPAP53621 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPAP53621 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPAP53621 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPAP53621 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPAP53621 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPAP53621 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPAP53621 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPAP53621 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPAP53621 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPAP53621 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPAP53621 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPAP53621 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPAP53621 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms