Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THOP1P52888 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THOP1P52888 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THOP1P52888 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THOP1P52888 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THOP1P52888 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THOP1P52888 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THOP1P52888 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THOP1P52888 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THOP1P52888 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
THOP1P52888 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THOP1P52888 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
THOP1P52888 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THOP1P52888 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THOP1P52888 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THOP1P52888 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
THOP1P52888 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
THOP1P52888 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
THOP1P52888 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THOP1P52888 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
THOP1P52888 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THOP1P52888 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THOP1P52888 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
THOP1P52888 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THOP1P52888 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
THOP1P52888 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
THOP1P52888 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
THOP1P52888 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
THOP1P52888 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
THOP1P52888 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THOP1P52888 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
THOP1P52888 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
THOP1P52888 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THOP1P52888 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
THOP1P52888 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
THOP1P52888 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THOP1P52888 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THOP1P52888 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
THOP1P52888 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THOP1P52888 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THOP1P52888 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
THOP1P52888 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
THOP1P52888 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THOP1P52888 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THOP1P52888 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THOP1P52888 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THOP1P52888 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
THOP1P52888 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
THOP1P52888 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
THOP1P52888 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THOP1P52888 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
THOP1P52888 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THOP1P52888 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
THOP1P52888 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THOP1P52888 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THOP1P52888 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THOP1P52888 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THOP1P52888 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THOP1P52888 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THOP1P52888 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THOP1P52888 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THOP1P52888 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THOP1P52888 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THOP1P52888 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THOP1P52888 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THOP1P52888 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THOP1P52888 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THOP1P52888 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THOP1P52888 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THOP1P52888 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THOP1P52888 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
THOP1P52888 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THOP1P52888 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms