Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST1P52848 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDST1P52848 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDST1P52848 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDST1P52848 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDST1P52848 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDST1P52848 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDST1P52848 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDST1P52848 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDST1P52848 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDST1P52848 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDST1P52848 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDST1P52848 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDST1P52848 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDST1P52848 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NDST1P52848 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDST1P52848 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDST1P52848 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDST1P52848 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDST1P52848 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDST1P52848 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDST1P52848 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDST1P52848 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDST1P52848 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDST1P52848 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDST1P52848 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NDST1P52848 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDST1P52848 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDST1P52848 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDST1P52848 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDST1P52848 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDST1P52848 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDST1P52848 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDST1P52848 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDST1P52848 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDST1P52848 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NDST1P52848 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDST1P52848 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDST1P52848 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDST1P52848 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDST1P52848 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NDST1P52848 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NDST1P52848 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDST1P52848 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDST1P52848 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDST1P52848 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDST1P52848 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NDST1P52848 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDST1P52848 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDST1P52848 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDST1P52848 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDST1P52848 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDST1P52848 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDST1P52848 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDST1P52848 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDST1P52848 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDST1P52848 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDST1P52848 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDST1P52848 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDST1P52848 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDST1P52848 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDST1P52848 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDST1P52848 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDST1P52848 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDST1P52848 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NDST1P52848 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDST1P52848 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDST1P52848 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDST1P52848 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDST1P52848 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDST1P52848 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDST1P52848 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDST1P52848 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDST1P52848 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDST1P52848 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDST1P52848 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDST1P52848 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NDST1P52848 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDST1P52848 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDST1P52848 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDST1P52848 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDST1P52848 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDST1P52848 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms