Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RND2P52198 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RND2P52198 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RND2P52198 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RND2P52198 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RND2P52198 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RND2P52198 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RND2P52198 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RND2P52198 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RND2P52198 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RND2P52198 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RND2P52198 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RND2P52198 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RND2P52198 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RND2P52198 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RND2P52198 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RND2P52198 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RND2P52198 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RND2P52198 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RND2P52198 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RND2P52198 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RND2P52198 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RND2P52198 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RND2P52198 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RND2P52198 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RND2P52198 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RND2P52198 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RND2P52198 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RND2P52198 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RND2P52198 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RND2P52198 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RND2P52198 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RND2P52198 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RND2P52198 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RND2P52198 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms