Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK3P51956 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK3P51956 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK3P51956 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK3P51956 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK3P51956 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK3P51956 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK3P51956 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK3P51956 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK3P51956 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK3P51956 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK3P51956 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK3P51956 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK3P51956 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK3P51956 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK3P51956 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK3P51956 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK3P51956 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK3P51956 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK3P51956 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK3P51956 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK3P51956 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK3P51956 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK3P51956 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK3P51956 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK3P51956 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK3P51956 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK3P51956 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK3P51956 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK3P51956 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK3P51956 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK3P51956 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK3P51956 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK3P51956 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK3P51956 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK3P51956 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK3P51956 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK3P51956 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK3P51956 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK3P51956 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK3P51956 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK3P51956 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK3P51956 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK3P51956 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK3P51956 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK3P51956 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK3P51956 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK3P51956 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK3P51956 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK3P51956 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK3P51956 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK3P51956 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK3P51956 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK3P51956 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK3P51956 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEK3P51956 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEK3P51956 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEK3P51956 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEK3P51956 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEK3P51956 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms