Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LUMP51884 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LUMP51884 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LUMP51884 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LUMP51884 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LUMP51884 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LUMP51884 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LUMP51884 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LUMP51884 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LUMP51884 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LUMP51884 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LUMP51884 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LUMP51884 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LUMP51884 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LUMP51884 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LUMP51884 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LUMP51884 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LUMP51884 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LUMP51884 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LUMP51884 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LUMP51884 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LUMP51884 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LUMP51884 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LUMP51884 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LUMP51884 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LUMP51884 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LUMP51884 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LUMP51884 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LUMP51884 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LUMP51884 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LUMP51884 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LUMP51884 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LUMP51884 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LUMP51884 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LUMP51884 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LUMP51884 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LUMP51884 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LUMP51884 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LUMP51884 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LUMP51884 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LUMP51884 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LUMP51884 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LUMP51884 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LUMP51884 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LUMP51884 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LUMP51884 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LUMP51884 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LUMP51884 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LUMP51884 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LUMP51884 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LUMP51884 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LUMP51884 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LUMP51884 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LUMP51884 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LUMP51884 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LUMP51884 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LUMP51884 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LUMP51884 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LUMP51884 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LUMP51884 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LUMP51884 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LUMP51884 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LUMP51884 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LUMP51884 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LUMP51884 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LUMP51884 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms