Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms