Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE6CP51160 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE6CP51160 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms