Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSK3BP49841 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms