Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC2P49815 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC2P49815 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC2P49815 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC2P49815 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC2P49815 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC2P49815 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC2P49815 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC2P49815 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC2P49815 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC2P49815 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC2P49815 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSC2P49815 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TSC2P49815 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSC2P49815 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSC2P49815 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSC2P49815 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSC2P49815 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSC2P49815 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSC2P49815 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSC2P49815 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSC2P49815 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSC2P49815 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSC2P49815 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSC2P49815 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC2P49815 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC2P49815 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC2P49815 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC2P49815 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC2P49815 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSC2P49815 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSC2P49815 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSC2P49815 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSC2P49815 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSC2P49815 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSC2P49815 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSC2P49815 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSC2P49815 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSC2P49815 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSC2P49815 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSC2P49815 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSC2P49815 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSC2P49815 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSC2P49815 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSC2P49815 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSC2P49815 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSC2P49815 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSC2P49815 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TSC2P49815 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSC2P49815 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSC2P49815 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSC2P49815 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSC2P49815 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSC2P49815 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSC2P49815 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC2P49815 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC2P49815 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC2P49815 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC2P49815 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC2P49815 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC2P49815 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC2P49815 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSC2P49815 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC2P49815 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC2P49815 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC2P49815 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC2P49815 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSC2P49815 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TSC2P49815 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSC2P49815 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSC2P49815 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSC2P49815 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC2P49815 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC2P49815 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC2P49815 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC2P49815 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC2P49815 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC2P49815 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC2P49815 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC2P49815 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC2P49815 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC2P49815 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC2P49815 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSC2P49815 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC2P49815 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC2P49815 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC2P49815 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC2P49815 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC2P49815 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC2P49815 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC2P49815 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC2P49815 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC2P49815 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC2P49815 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC2P49815 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC2P49815 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC2P49815 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC2P49815 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC2P49815 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSC2P49815 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms