Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFCP49767 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFCP49767 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms