Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA1P49639 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms