Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLMP48507 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLMP48507 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLMP48507 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCLMP48507 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLMP48507 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLMP48507 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLMP48507 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLMP48507 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLMP48507 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLMP48507 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLMP48507 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLMP48507 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLMP48507 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLMP48507 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLMP48507 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLMP48507 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLMP48507 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCLMP48507 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLMP48507 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLMP48507 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLMP48507 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLMP48507 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLMP48507 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLMP48507 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLMP48507 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLMP48507 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLMP48507 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLMP48507 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLMP48507 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLMP48507 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLMP48507 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLMP48507 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLMP48507 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCLMP48507 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCLMP48507 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCLMP48507 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLMP48507 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLMP48507 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLMP48507 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLMP48507 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLMP48507 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLMP48507 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLMP48507 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCLMP48507 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLMP48507 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLMP48507 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLMP48507 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLMP48507 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLMP48507 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLMP48507 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCLMP48507 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLMP48507 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLMP48507 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLMP48507 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLMP48507 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLMP48507 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLMP48507 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLMP48507 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLMP48507 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCLMP48507 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCLMP48507 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms