Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRB2P47870 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB2P47870 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms