Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABIFP47224 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABIFP47224 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABIFP47224 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RABIFP47224 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RABIFP47224 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABIFP47224 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABIFP47224 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABIFP47224 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABIFP47224 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABIFP47224 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABIFP47224 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABIFP47224 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABIFP47224 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABIFP47224 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABIFP47224 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABIFP47224 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABIFP47224 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABIFP47224 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABIFP47224 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABIFP47224 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABIFP47224 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABIFP47224 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABIFP47224 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABIFP47224 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABIFP47224 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABIFP47224 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABIFP47224 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABIFP47224 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABIFP47224 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABIFP47224 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABIFP47224 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABIFP47224 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABIFP47224 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABIFP47224 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RABIFP47224 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABIFP47224 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABIFP47224 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABIFP47224 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABIFP47224 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABIFP47224 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RABIFP47224 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABIFP47224 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABIFP47224 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABIFP47224 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABIFP47224 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABIFP47224 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABIFP47224 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABIFP47224 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABIFP47224 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABIFP47224 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABIFP47224 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABIFP47224 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABIFP47224 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABIFP47224 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABIFP47224 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABIFP47224 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABIFP47224 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABIFP47224 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RABIFP47224 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABIFP47224 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABIFP47224 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABIFP47224 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABIFP47224 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABIFP47224 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABIFP47224 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABIFP47224 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABIFP47224 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABIFP47224 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABIFP47224 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABIFP47224 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABIFP47224 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABIFP47224 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABIFP47224 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABIFP47224 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABIFP47224 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABIFP47224 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABIFP47224 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABIFP47224 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABIFP47224 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABIFP47224 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABIFP47224 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABIFP47224 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABIFP47224 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABIFP47224 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABIFP47224 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABIFP47224 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RABIFP47224 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABIFP47224 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABIFP47224 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABIFP47224 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABIFP47224 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABIFP47224 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABIFP47224 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABIFP47224 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABIFP47224 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABIFP47224 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABIFP47224 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABIFP47224 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RABIFP47224 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms