Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL21P46778 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL21P46778 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL21P46778 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL21P46778 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL21P46778 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL21P46778 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL21P46778 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL21P46778 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL21P46778 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL21P46778 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL21P46778 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL21P46778 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL21P46778 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL21P46778 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL21P46778 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL21P46778 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL21P46778 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL21P46778 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL21P46778 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL21P46778 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL21P46778 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL21P46778 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL21P46778 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL21P46778 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL21P46778 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL21P46778 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL21P46778 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL21P46778 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL21P46778 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL21P46778 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL21P46778 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL21P46778 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL21P46778 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL21P46778 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL21P46778 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL21P46778 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL21P46778 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL21P46778 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL21P46778 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL21P46778 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL21P46778 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL21P46778 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL21P46778 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL21P46778 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL21P46778 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL21P46778 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL21P46778 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL21P46778 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL21P46778 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL21P46778 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL21P46778 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL21P46778 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL21P46778 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL21P46778 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL21P46778 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL21P46778 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL21P46778 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL21P46778 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL21P46778 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL21P46778 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL21P46778 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL21P46778 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL21P46778 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL21P46778 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL21P46778 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL21P46778 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL21P46778 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL21P46778 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL21P46778 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL21P46778 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL21P46778 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL21P46778 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL21P46778 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL21P46778 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL21P46778 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL21P46778 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL21P46778 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL21P46778 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL21P46778 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL21P46778 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL21P46778 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL21P46778 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL21P46778 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL21P46778 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL21P46778 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL21P46778 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL21P46778 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL21P46778 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL21P46778 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL21P46778 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms