Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP2P46087 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP2P46087 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP2P46087 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP2P46087 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP2P46087 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP2P46087 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP2P46087 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP2P46087 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP2P46087 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP2P46087 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP2P46087 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP2P46087 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP2P46087 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP2P46087 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP2P46087 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP2P46087 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP2P46087 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP2P46087 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP2P46087 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP2P46087 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP2P46087 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOP2P46087 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP2P46087 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP2P46087 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP2P46087 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP2P46087 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP2P46087 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP2P46087 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP2P46087 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP2P46087 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP2P46087 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP2P46087 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOP2P46087 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP2P46087 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP2P46087 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP2P46087 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP2P46087 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP2P46087 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP2P46087 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP2P46087 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP2P46087 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP2P46087 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP2P46087 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP2P46087 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOP2P46087 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP2P46087 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP2P46087 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP2P46087 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP2P46087 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP2P46087 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP2P46087 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP2P46087 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP2P46087 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP2P46087 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP2P46087 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP2P46087 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOP2P46087 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOP2P46087 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP2P46087 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP2P46087 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP2P46087 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP2P46087 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP2P46087 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP2P46087 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP2P46087 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP2P46087 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP2P46087 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP2P46087 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP2P46087 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP2P46087 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP2P46087 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP2P46087 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOP2P46087 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOP2P46087 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOP2P46087 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOP2P46087 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOP2P46087 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOP2P46087 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NOP2P46087 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOP2P46087 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NOP2P46087 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOP2P46087 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms