Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA4P43681 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms