Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PIK3CBP42338 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms