Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK1P39086 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms