Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZEB1P37275 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZEB1P37275 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZEB1P37275 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms