Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5C1P36542 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5C1P36542 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms