Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT2P35908 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT2P35908 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT2P35908 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT2P35908 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT2P35908 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT2P35908 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT2P35908 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT2P35908 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT2P35908 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT2P35908 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT2P35908 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT2P35908 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT2P35908 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT2P35908 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT2P35908 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT2P35908 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT2P35908 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT2P35908 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT2P35908 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT2P35908 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT2P35908 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT2P35908 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT2P35908 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT2P35908 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT2P35908 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT2P35908 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT2P35908 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT2P35908 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT2P35908 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT2P35908 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT2P35908 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT2P35908 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT2P35908 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT2P35908 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT2P35908 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT2P35908 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT2P35908 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT2P35908 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT2P35908 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT2P35908 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT2P35908 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT2P35908 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT2P35908 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT2P35908 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT2P35908 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT2P35908 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT2P35908 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT2P35908 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT2P35908 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT2P35908 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT2P35908 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT2P35908 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT2P35908 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT2P35908 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT2P35908 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT2P35908 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT2P35908 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT2P35908 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT2P35908 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT2P35908 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT2P35908 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT2P35908 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT2P35908 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT2P35908 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT2P35908 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT2P35908 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT2P35908 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT2P35908 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT2P35908 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT2P35908 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT2P35908 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT2P35908 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT2P35908 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT2P35908 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT2P35908 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT2P35908 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT2P35908 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT2P35908 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT2P35908 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT2P35908 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT2P35908 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT2P35908 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT2P35908 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT2P35908 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT2P35908 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT2P35908 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT2P35908 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT2P35908 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT2P35908 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT2P35908 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT2P35908 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT2P35908 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT2P35908 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT2P35908 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT2P35908 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT2P35908 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT2P35908 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT2P35908 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT2P35908 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms