Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA4P35212 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA4P35212 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA4P35212 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA4P35212 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA4P35212 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA4P35212 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA4P35212 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA4P35212 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA4P35212 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA4P35212 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA4P35212 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA4P35212 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA4P35212 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA4P35212 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA4P35212 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA4P35212 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA4P35212 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA4P35212 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA4P35212 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA4P35212 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA4P35212 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA4P35212 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA4P35212 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA4P35212 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA4P35212 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA4P35212 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA4P35212 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA4P35212 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA4P35212 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA4P35212 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA4P35212 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA4P35212 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA4P35212 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA4P35212 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA4P35212 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA4P35212 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA4P35212 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA4P35212 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA4P35212 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA4P35212 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA4P35212 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA4P35212 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA4P35212 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA4P35212 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA4P35212 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA4P35212 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA4P35212 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA4P35212 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA4P35212 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA4P35212 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA4P35212 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA4P35212 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA4P35212 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA4P35212 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA4P35212 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA4P35212 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA4P35212 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA4P35212 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA4P35212 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA4P35212 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA4P35212 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA4P35212 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA4P35212 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA4P35212 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA4P35212 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA4P35212 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA4P35212 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA4P35212 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA4P35212 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA4P35212 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA4P35212 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA4P35212 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA4P35212 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA4P35212 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA4P35212 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA4P35212 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA4P35212 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA4P35212 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA4P35212 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA4P35212 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA4P35212 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA4P35212 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA4P35212 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA4P35212 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA4P35212 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA4P35212 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA4P35212 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA4P35212 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA4P35212 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA4P35212 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA4P35212 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA4P35212 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA4P35212 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA4P35212 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA4P35212 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA4P35212 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA4P35212 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA4P35212 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA4P35212 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms