Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSG3P32926 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSG3P32926 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSG3P32926 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSG3P32926 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSG3P32926 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSG3P32926 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG3P32926 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG3P32926 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG3P32926 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG3P32926 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG3P32926 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG3P32926 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG3P32926 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG3P32926 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG3P32926 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG3P32926 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG3P32926 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSG3P32926 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSG3P32926 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DSG3P32926 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DSG3P32926 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSG3P32926 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSG3P32926 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSG3P32926 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSG3P32926 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSG3P32926 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG3P32926 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG3P32926 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG3P32926 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG3P32926 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DSG3P32926 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
DSG3P32926 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG3P32926 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG3P32926 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG3P32926 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG3P32926 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG3P32926 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG3P32926 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG3P32926 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG3P32926 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG3P32926 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG3P32926 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG3P32926 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG3P32926 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG3P32926 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG3P32926 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG3P32926 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG3P32926 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG3P32926 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG3P32926 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG3P32926 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG3P32926 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG3P32926 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG3P32926 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG3P32926 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG3P32926 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG3P32926 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG3P32926 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG3P32926 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG3P32926 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG3P32926 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG3P32926 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG3P32926 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG3P32926 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG3P32926 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG3P32926 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG3P32926 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG3P32926 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG3P32926 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG3P32926 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG3P32926 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG3P32926 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG3P32926 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG3P32926 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG3P32926 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG3P32926 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG3P32926 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG3P32926 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG3P32926 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG3P32926 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG3P32926 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG3P32926 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG3P32926 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG3P32926 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG3P32926 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG3P32926 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG3P32926 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG3P32926 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG3P32926 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG3P32926 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG3P32926 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG3P32926 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG3P32926 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG3P32926 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG3P32926 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG3P32926 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG3P32926 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG3P32926 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG3P32926 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms